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Coronavirus SARS-CoV-2 : co-circulation du SARS-CoV-2 et des virus hivernaux

Dans le contexte de circulation persistante du SARS-CoV-2 et de circulation des virus hivernaux, le HCSP recommande les mesures suivantes.

En population générale :

  • la promotion de la vaccination contre la grippe chez les personnes éligibles dans le calendrier des vaccinations 2020 en particulier chez le personnel soignant ;
  • le maintien strict, au cours de la période hivernale, des mesures barrières ;
  • la recherche de SARS-CoV-2 par RT-PCR (enfants de moins de 6 ans voir ci-dessous) dans un prélèvement respiratoire haut, devant tout signe évocateur de Covid-19 ou en cas de contact à risque avec une personne infectée ;
  • un test diagnostique de la grippe conformément aux pratiques habituelles (collectivité à risque, infection respiratoire grave nécessitant un hospitalisation …) en privilégiant les tests moléculaires, notamment chez l’adulte ;
  • la recherche simultanée du virus grippal et du SARS-CoV-2 prioritairement chez les personnes à risque de formes graves et en période de co-circulation grippale.
  • Pour les collectivités de personnes âgées :
  • de renforcer les recommandations de vaccination contre la grippe chez les résidents et chez le personnel soignant conformément aux recommandations du calendrier des vaccinations ;
  • de renforcer la surveillance clinique à la recherche de symptômes en faveur d’une infection respiratoire aiguë ;
  • d’utiliser des tests moléculaires pour dépister en parallèle le SARS-CoV-2 et les virus grippaux.

Chez les enfants de moins de 6 ans, les référentiels de prise en charge et de surveillance (recherche de signes de gravité) des maladies virales épidémiques restent valides. L’avis précise les situations dans lesquelles la recherche de SARS-CoV-2 n’est pas indiquée, est indiquée rapidement ou doit être réalisée secondairement du fait de l’évolution.

Au-delà de l’âge de 6 ans, en raison de la moindre fréquence des infections virales saisonnières, les indications de test Covid-19 peuvent être élargies, comme chez l’adulte, en dehors de contextes épidémiques très évocateurs.

S’agissant de la place des tests de diagnostic multiplex, suivant les recommandations indiquées ci-dessus, un test de diagnostic rapide ou un test de RT-PCR recherchant le virus respiratoire syncytial (VRS), les virus grippaux ou le rotavirus, est recommandé pour préciser le diagnostic en cas de symptômes compatibles. Dans les cas douteux où une co-infection avec le SARS-CoV-2 est suspectée, il convient d’effectuer la recherche en parallèle de cet agent, en utilisant de préférence un test multiplex pour les pathogènes respiratoires si celui-ci est disponible à un coût raisonnable.

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